Цистеамина гидрохлорид можно использовать в производстве косметики, пищевых добавок, противоязвенных лекарств, а также в производстве биохимических реагентов и комплексных агентов тяжелых ионов. Он может вступать в реакцию с ферментом человеческого организма и стабилизировать свою работоспособность при наличии радиации, поэтому его можно использовать при лечении лучевого синдрома и яда тетраэтилсвинца. Его можно делать в виде таблеток или инъекций.